Está constituida por tres franjas horizontales: azul, blanco y verde; y un triángulo rojo entre ellas, en el lado izquierdo.

La franja azul significa el cielo diáfano que predomina en la provincia, principalmente en la pampa. Durante el verano, es un manto zafiro, en la fertilidad de los días.

La franja blanca simboliza la amistad sincera, la hospitalidad y la paz que perdura en la tierra guanacasteca.

La franja verde es el follaje del árbol de Guanacaste, los pastizales, los cultivos, el trabajo de todos y todas las guanacastecas. El triángulo rojo exalta el corazón generoso del guanacasteco y la guanacasteca, su afecto y alegría tradicionales, su valor y espíritu de lucha demostrado en múltiples oportunidades. En la Bandera de Guanacaste se reúnen la Bandera de Costa Rica y el verde distintivo guanacasteco.

Es un símbolo de esplendor espiritual, se debe respetar y utilizar en todo acto cívico que se lleve a cabo en la provincia. Fue creada por el distinguido ciudadano Tilaranense Eddy Alvarado.